Los programas de Prevención y Mantenimiento de la ESE Hospital Santa Margarita ofrecen servicios integrados con el fin de llevar a cabo acciones, procedimientos, intervenciones y actividades que permitan mejorar las condiciones de salud del usuario y su familia; cuenta con la atención de programas como:
Programa ampliado de inmunizaciones (Vacunación).
Atención del parto.
Atención del recién nacido (IAMII).
Planificación familiar.
Crecimiento y desarrollo.
Control prenatal.
Programa del joven sano.
Programa del adulto sano.
Detección precoz del cáncer de cuello uterino.
Detección precoz del cáncer de mama.
Salud visual (Agudeza visual).
Programa de hipertensión.
Programa de diabetes.
Programa de dislipidemias.
Programa de control de la tuberculosis.
Programa ampliado de inmunizaciones (Vacunación).
Programa vigilancia de enfermedades en salud pública.
Programa para la atención de infecciones de transmisión sexual.